Oltre allo stack di software libero java-gcj-compat, Fedora Core permetterà di installare molteplici implementazioni Java e cambiare fra loro usando lo strumento a linea di comando alternatives. Comunque, ogni sistema Java installato dovrà essere pacchettizzato usando le linee guida del JPackage Project per ottenere beneficio da alternatives. Una volta che questi pacchetti sono installati correttamente, l'utente root potrà cambiare fra le implementazioni java e javac usando il comando alternatives:

alternatives --config java  
alternatives --config javac

Le librerie JNI a 64-bit distribuite per impostazione predefinita sui sistemi a 64-bit in Fedora Core ed Extras non sono eseguibili sulle JREs a 32-bit. Perciò si deve passare ad un alternativa java a 64-bit, od installare la versione a 32-bit dei pacchetti, se disponibili. Per installare una versione a 32-bit, usare il seguente comando:

yum install <package_name>.i386 

Allo stesso modo, le librerie JNI a 32-bit distribuite per impostazione predefinita sui sistemi ppc64 non funzioneranno con una JRE a 64-bit. Per installare la versione a 64-bit, usare il seguente comando:

yum install <package_name>.ppc64 

Questa versione di Fedora Core include una versione di anteprima di gcjwebplugin, un plugin per Firefox per le applets Java. gcjwebplugin non è abilitato per impostazione predefinita. Nonostante l'implementazione di sicurezza in GNU Classpath sia stata attivamente sviluppata, non è abbastanza matura per eseguire applets prive di fiducia con sicurezza. D'altra parte, le implementazioni AWT e Swing in GNU Classpath sono ora sufficientemente mature per eseguire molte delle applets distribuite nel web. Gli utenti avventurosi che vogliono provare gcjwebplugin possono leggere /usr/share/doc/libgcj-4.1.1/README.libgcjwebplugin.so, installato dal gcc rpm. Il README spiega come abilitare il plugin ed i rischi associati nel farlo.

Fedora Core include molti pacchetti derivati dal JPackage Project, che fornisce un repositorio di software Java. Questi pacchetti sono modificati in Fedora per rimuovere le dipendenze a software proprietario e far uso della caratteristica di compilazione di GCJ ahead-of-time. Si usino i repositori Fedora per aggiornare questi pacchetti, od il repositorio JPackage per quei pacchetti non forniti da Fedora. Fare riferimento al sito web di JPackage su http://jpackage.org per maggiori informazioni sul progetto ed il software che fornisce.

	Mescolare pacchetti fra Fedora e JPackage
	Verificare la compatibilità dei pacchetti prima di installare software da entrambe i repositori Fedora e JPackage sullo stesso sistema. Pacchetti incompatibili possono causare problemi complessi.

Questa versione di Fedora Core include Fedora Eclipse, che è basata sulla Eclipse SDK versione 3.2. La pagina "New and Noteworthy" per questa versione è accessibile da qui.

Rilasciata a giugno 2006, l'SDK è svariatamente conosciuto come "the Eclipse Platform," "the Eclipse IDE," ed "Eclipse." L'Eclipse SDK è il fondamento per le versioni combinate di dieci progetti Eclipse sotto la versione combinata Callisto. Una parte di questi progetti Callisto sono inclusi in Fedora Core ed Extras: CDT, per lo sviluppo C/C++, e GEF, il Graphical Editing Framework.

Speriamo di aumentare questi progetti con altri mentre il ciclo di Fedora va avanti. Trai candidati proposti per l'inclusione ci sono EMF, l'Eclipse Modeling Framework, e VE, il Visual Editor. Mentre stiamo scrivendo, è attesa una versione aggiornata di PyDev, gli strumenti di sviluppo Python, che saranno disponibili in Fedora Extras. Assistenza per mantenere questi progetti pacchettizzati e testati con GCJ è sempre la benvenuta. Contattare le parti interessate attraverso la fedora-devel-java-list e/o #fedora-java su freenode.

Fedora include anche plugins e caratteristiche che sono particolarmente utili per gli hackers FOSS: ChangeLog editare con eclipse-changelog e l'interazione di Bugzilla con eclipse-bugzilla. I nostri pacchetti CDT includono inoltre un supporto work-in-progress per lo GNU Autotools. Le ultime informazioni riguardanti questi progetti possono essere trovate sulla pagina del Fedora Eclipse Project.