Een volledige installatie van Fedora bevat meer dan 1000 toepassings en bibliotheek pakketten. De meeste serverbeheerders zullen er echter niet voor kiezen om ieder pakket in de distributie te installeren, maar zullen er de voorkeur aangeven om een installatie van basis pakketten uit te voeren, plus een aantal server toepassingen.

Het komt onder systeembeheerders vaak voor om het operating systeem te installeren zonder aandacht te schenken aan welke programma's er in feite geinstalleerd worden. Dit kan een probleem zijn omdat onnodige services geinstalleerd kunnen worden, ingesteld met standaard instellingen, en mogelijk aangezet. Dit veroorzaakt dat onnodige services, zoals Telnet, DHCP, of DNS, op een server of werkstation draaien zonder dat de beheerder zich dit realiseert, wat op zijn beurt kan leiden tot ongewenst verkeer naar de server, of zelfs, een potentiele weg in het systeem voor crackers. Refereer naar Paragraaf 2.2, “Server beveiliging” voor informatie over het sluiten van poorten en het uitzetten van niet gebruikte services.