Programari per a neuroimatge
Paquets aigües amunt
Les eines següents es troben entre el programari que s’està provant actualment a NeuroFedora i es poden instal·lar directament des de les forges originals (per exemple, PyPi). Podeu veure l’enllaç dels resultats de les proves: aquí.
Paquets de Python
| Programari | Resum | pip (PyPi) | Notes |
|---|---|---|---|
enllaç: dipy |
Imatges de ressonància magnètica de difusió en Python. |
|
|
enllaç:https://popy.org/project/mne/yumneshch |
Projecte MNE-Potkhon per a l’anàlisi de dades MEZH i EEG. |
ёмнеё |
|
enllaç: mne-bids |
MNE-BIDS: Organització de dades MEG, EEG i iEEG segons l’especificació BIDS i facilitació de la seva anàlisi amb MNE-Python. |
|
|
enllaç: nilearn |
Aprenentatge estadístic per a neuroimatge en Python. |
|
|
enllaç: nipy |
Un paquet de Python per a l’anàlisi de dades de neuroimatge. |
|
|
enllaç: nipype |
Neuroimatge en Python: Canalitzacions i interfícies. |
|
|
enllaç: pybids |
bids: interfície amb conjunts de dades que s’ajusten a BIDS. |
|
|
enllaç: wxnatpy |
Navegador de repositoris XNAT de wxPython. |
|
No es compila des de PyPi |
Paquets de sistema
Els següents s’inclouen als repositoris:
| Programari | Instal·lació amb | Notes |
|---|---|---|
enllaç: Alizams |
|
Un visor DICOM. |
enllaç: DICOMAnonymizer |
|
Un anonimitzador multifil per a fitxers DICOM que implementa la majoria de DICOM PS 3.15 AnnexE |
enllaç: dipy |
|
Utilitats de ressonància magnètica de difusió en Python. |
enllaç: ephyviewer |
|
Una biblioteca de Python basada en pyqtgraph per crear visualitzadors personalitzats per a senyals electrofisiològics, vídeo, esdeveniments, èpoques, trens de pics, taules de dades i representacions de temps-freqüència de senyals. |
enllaç:https://src.fedoraproject.org/rpms/python-fsleyes[fsleyes] |
|
FSLeyes, el visualitzador d’imatges FSL. |
enllaç:https://src.fedoraproject.org/rpms/gifticlib[gifticlib] |
|
Implementació d’E/S de referència per a GIFTI |
enllaç:https://src.fedoraproject.org/rpms/python-giftiio[giftiio] |
|
Biblioteca de Python per treballar amb GIFTI. |
enllaç: jnifti |
|
Un lector NIfTI-1/2 ràpid i un convertidor de NIfTI a JNIfTI |
enllaç: nilearn |
|
Mòdul Python per a un aprenentatge estadístic ràpid i fàcil sobre dades de neuroimatge. |
enllaç: nistats |
|
Modelització i anàlisi estadística de dades de ressonància magnètica funcional en Python. |
enllaç: octave-dicom |
|
dicom: fitxer i/o per a imatges mèdiques i altres dades. |
enllaç: pybids |
|
Interfície amb conjunts de dades conformes a BIDS. |
enllaç: petlink |
|
Descodifica i codifica els fluxos de dades de Petlink (32 i 64 bits). |
enllaç: pynetdicom |
|
Una implementació en Python del protocol de xarxa DICOM. |
El programari que està a la cua d’inclusió es troba a l’enllaç: https://pagure.io/neuro-sig/NeuroFedora/issues?tags=F%3A+Neuroimaging [aquí].
Want to help? Learn how to contribute to Fedora Docs ›