Software für Neuro-Bildgebung
Upstream-Pakete
Die folgenden Werkzeuge gehören zu der Software, die derzeit in NeuroFedora getestet wird und direkt von den Upstream-Forges (z.B. PyPi) installiert werden kann. Die Testergebnisse finden Sie hier.
Python-Pakete
| Software | Zusammenfassung | pip (PyPi) | Hinweise |
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Diffusions-MRT-Bildgebung in Python. |
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MNE-Python-Projekt zur Analyse von MEG- und EEG-Daten. |
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MNE-BIDS: Organisation von MEG-, EEG- und iEEG-Daten gemäß der BIDS-Spezifikation und Erleichterung ihrer Analyse mit MNE-Python. |
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Statistisches Lernen für die Neurobildgebung in Python. |
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Ein Python-Paket zur Analyse von neurobildgebenden Daten. |
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Neurobildgebung in Python: Pipelines und Schnittstellen. |
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bids: Schnittstelle zu Datensätzen, die dem BIDS-Standard entsprechen. |
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wxPython-basierter XNAT Repository-Browser. |
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Lässt sich nicht aus dem PyPi bauen |
Systempakete
Folgendes ist in den Paketquellen verfügbar:
| Software | Installieren mit | Hinweise |
|---|---|---|
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Ein DICOM-Betrachter. |
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Ein Multithread-Anonymisierer für DICOM-Dateien, der den Großteil von DICOM PS 3.15 AnnexE implementiert. |
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Diffusions-MRI-Dienstprogramme in Python. |
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Eine auf pyqtgraph basierende Python-Bibliothek zum Erstellen benutzerdefinierter Betrachter für elektrophysiologische Signale, Videos, Ereignisse, Epochen, Spike-Trains, Datentabellen und Zeit-Frequenz-Darstellungen von Signalen. |
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FSLeyes, der FSL-Bildbetrachter. |
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E/A-Referenzimplementierung für GIFTI |
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Python-Bibliothek für die Arbeit mit GIFTI. |
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Ein schneller NIfTI-1/2-Leser und NIfTI-zu-JNIfTI-Konverter |
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Python-Modul für schnelles und einfaches statistisches Lernen mit NeuroImaging-Daten. |
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Modellierung und statistische Analyse von fMRI-Daten in Python. |
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dicom: Datei-E/A für medizinische Bilder und andere Daten. |
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Schnittstelle mit BIDS-konformen Datensätzen. |
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Petlink-Datenströme dekodieren und kodieren (32 und 64 bit). |
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Eine Python-Implementierung des DICOM-Netzworkprotokolls. |
Software, die sich auf der Warteliste für die Aufnahme befindet, ist hier aufgelistet.
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