Software para análisis de datos
Paquetes en proyecto
Las herramientas siguientes están entre el software disponible actualmente en NeuroFedora y puede ser instalado directamente desde las forjas en desarrollo (p.ej., PyPi). Puede ver los resultados de las pruebas aquí.
Paquetes de Python
| Software | Resumen | pip (PyPi) | Notas |
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bibliotecas principales para AllenSDK. |
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Análisis y visualización de datos mediante estimación acoplada Bootstrap.. |
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Cliente de línea de comandos para interactuar con instancias de DANDI. |
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Biblioteca de extractos de funciones de Electrophys (eFEL). |
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Elephant (Electrophysiology Analysis Toolkit) es una biblioteca de fuente abierta para el análisis de datos electrofisiológicos en Python. |
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Utilidades para leer/escribir tipos de Python origen/destino de archivos HDF5, incluidos archivos MAT de MATLAB v7.3. |
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SDK de Python para interactuar con datos de neurociencia a través de la API de Boss. |
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Detección de picos y agrupamiento automático para la clasificación de picos. |
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Proyecto upstream sin mantenimiento |
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Un marco minimalista para la minería de reglas de asociación numéricas. |
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Pingouin: paquete estadístico para Python. |
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Paquete de Python para gestionar el diseño, la geometría y el cableado de la sonda al dispositivo. |
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Biblioteca de Python para leer archivos en formato binario Axon (ABF). |
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pybv: una utilidad de E/S ligera para el formato de datos BrainVision. |
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22 características canónicas de series temporales. |
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biblioteca para leer/escribir archivos EDF+/BDF+. |
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Una biblioteca de Python para el análisis de datos electrofisiológicos. |
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Paquete para trabajar con Neurodata almacenado en el formato NWB. |
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No funciona para py3.14+. https://github.com/NeurodataWithoutBorders/pynwb/issues/2143 |
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Aprendizaje automático para datos multivariados con geometría riemanniana. |
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Biblioteca para el análisis por pares de datos de series temporales. |
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Caja de herramientas unificada para el análisis de redes complejas y recurrencias. |
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Paquete de Python para importar archivos XDF (Formato de Datos Extensible). |
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Herramientas para análisis de sensibilidad global. Contiene Sobol', Morris, FAST, DGSM, PAWN, HDMR, Momento Independiente y métodos factorial fraccional. |
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Paquetes del sistema
Los siguientes elementos están incluidos en los repositorios:
| Software | Instalar con | Notas |
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Un paquete de Python para intérprete de archivo de datos AMPL/GMPL . |
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Proporciona la infraestructura para representar y analizar transacción de datos y patrones. |
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Unas herramientas completamente automatizado para generación de alta calidad de malla cerebral tetrahedral. |
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Implementaciones en Python de algoritmos de bandidos contextuales. |
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Interfaz Cython para el optimizador de coma interior IPOPT. |
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Una implementación rápida de la distancia editada (distancia Levenshtein) en Python. |
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Aplicación diseñada para rastrear múltiples objetos en grabaciones de vídeo. |
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Biblioteca de identificación de archivos para Python. |
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Un conjunto de herramientas para la generación y el análisis de mallas 3D basadas en imágenes médicas. |
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Una caja de herramientas para la simulación del transporte de fotones mediante el método Monte Carlo en 3D. |
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Paquete de Python para el manejo y la estimulación de matrices de multi‐electrodos (MEA). |
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Un simulador de transporte de fotones Monte Carlo basado en malla 3D. |
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Análisis de datos de magnetoencefalografía (MEG) y electroencefalografía (EEG). |
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Una biblioteca para el cálculo de equilibrios de Nash en juegos de dos jugadores. |
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Un paquete de Python para analizar y simular series temporales neuronales, utilizando procesamiento digital de señales. |
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Síntesis a gran escala de datos de neuroimagen funcional. |
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AutoML en Python. |
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Marco de trabajo para resolver tareas de clasificación utilizando algoritmos inspirados en la naturaleza. |
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Un paquete de Python para resolver problemas de optimización.. |
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Análisis de series temporales para datos de neurociencia. |
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Formato de archivo para almacenar metadatos de forma organizada. |
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Un paquete de C++ para resolver los problemas directos de la electroencefalografía (EEG) y la magneto‐encefalografía (MEG). |
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Un paquete de Python para trabajar con archivos NWB. |
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Una biblioteca de Python para el análisis numérico de la similitud de trenes de impulsos. |
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PySwarms es un conjunto de herramientas de investigación extensible para la optimización por enjambre de partículas (PSO) en Python. |
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Biblioteca de análisis de sensibilidad. |
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IGU para generación híbrida de datos de espiga de verdad fundamental (ground-truth) |
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Utilidades para flojo de archivos grandes (S3, HDFS, gzip, bz2, y más). |
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Una solución rápida y escalable para ordenación de espiga de grabación de escala grande extracelular. |
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Importa, exporta, procesa, analiza y ve mallas triangulares. |
Software que está en la cola para inclusión está enumerada aquí.
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