Utilidades
Paquetes en proyecto
Las herramientas siguientes están entre el software disponible actualmente en NeuroFedora y puede ser instalado directamente desde las forjas en desarrollo (p.ej., PyPi). Puede ver los resultados de las pruebas aquí.
Paquetes de Python
| Software | Resumen | pip (PyPi) | Notas |
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Airspeed es un motor de plantilla potente y fácil de usar para Python que apunta a un alto nivel de compatibilidad con la librería popular Velocity para Java. |
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Calcula de manera eficiente las derivadas del código NumPy. |
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Tramas interactivas y aplicaciones en el explorador desde Python. |
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Rastreador de publicaciones (y donaciones). |
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Implementación rápida del editor de distancia (Levenshtein distance). |
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Una implementación de fórmulas Wilkinson. |
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Librería Python para Geometría Cuantitativa 3D en Microscopía Computacional. |
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Visualizar Datos de Red con Gráficos de Hive. |
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Librería Python que analiza mensajes HL7 v2.x. |
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Extensión Matplotlib Jupyter. |
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Un paquete Python que proporciona una clase de matriz numérica evaluada de forma diferida, larray, basada en y compatible con matrices NumPy. |
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Prueba de Hipótesis Robusta de Parámetros de Ubicación Mediante la Prueba de Tipo Lq-Likelihood-Ratio en Python. |
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un servicio que trabaja con mallas. |
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Una colección de CLIs (Interfaces de Línea de Comandos) y funciones de python relacionadas con el manejo de la morfología. |
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Utilitidades para cargar, procesar y hacer gráficos de Neuropixels en Python. |
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compilar código Python usando LLVM. |
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Un marco de optimización de hiperparámetros. |
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Parametriza y ejecuta Jupyter y nteract Notebooks. |
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Una librería interactiva de código abierto de visualización de datoa para Python. |
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Usada en un portátil jupyter requiere |
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Una Gramática de Gráficos para Python. |
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Muestra las dependencias de módulo. |
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Un contenedor de Python wrapper para la implementación de la función de distancia de Earth Mover de Ofir Pele y Michael Werman . |
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No mantenida desde arriba |
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Minería de Conjuntos de Elementos Frecuentes e Inducción de Reglas de Asociación para Python. |
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Una librería Python para la creación de archivos y fragmentos LaTeX. |
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Requiere LaTeX |
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Lector práctico para archivos .mat de Matlab |
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Interfaz para el chip clase CoACH de INI por medio de Teensy basado en PLANE (Platform for Learning About Neuromorphic Engineering) (Plataforma para Aprendizaje Sobre Ingeniería Neuromórfica). |
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Sin mantenimiento upstream, no se instala |
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Librería Python para interactuar con dispositivos Cedrus XID, por ejemplo StimTracker, Riponda, RB-x40, c-pod y Lumina. |
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Requiere controladores ftd: https://pypi.org/project/ftd2xx/ |
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RatInABox: Un paquete para simular navegación y representación especial de datos neuronales en entornos 2D continuos. |
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Lee archivos ROI .zip o .roi generados con ImageJ. |
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Hiperparámetros de ajustes en modelos de aprendizaje Scikit y la selección de características mediante algoritmos evolutivos. |
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Búsqueda mediante algoritmos inspirados en la naturaleza sobre valores de parámetros específicos para un estimador de sklearn. |
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No se instala en Py3.12+. Sin módulo llamado 'numpy.distutils'. Sin módulo llamado 'numpy.distutils' |
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Sistema de gestión de flujos de trabajo para crear análisis de datos reproducibles y escalables. |
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Gestores de referencia/bibliografía
Fedora actualmente no incluye ninguna de estas herramientas. Sin embargo, los desarrolladores proporcionan binarios pre-compilados que están preparadas para su uso.
Gestor completo de características de bibliografía escritos en Java. |
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Cliente Zotero. Además puede crear una cuenta en el servicio-web Zotero y utilizarlo para sincronizar su bibliografías entre diferentes máquinas. |
Paquetes del sistema
Las siguientes utilidades de propósito general son incluidas dentro de los repositorios:
| Software | Instalar con | Notas |
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Utilidades para trabajar con archivos del software AcqKnowlege de BIOPAC. |
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Biblioteca de optimización de Python Blue Brain |
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Herramienta numérica para realizar la cuantificación de la incertidumbre mediante polinomios. |
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Grupo de conexiones seguro para subprocesos en Python. |
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Mantén el código, los datos y los contenedores bajo control con git y git-annex. |
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Trie ultrarrápido y de almacenamiento eficiente para Python. |
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Paquete de Python para leer, desplazar en el tiempo y escribir datos de sensores. |
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Versión en C++ de earcut.js, una biblioteca de triangulación de polígonos rápida y que solo requiere encabezados. |
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Biblioteca C/C++ para leer/escribir archivos EDF+ y BDF+. |
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Estructura de directorios estándar para flujos de trabajo experimentales. |
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Un generador automático de registros de cambios que utiliza plantillas Jinja2. De registros de Git a registros de cambios. |
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GNU Octave: Lenguaje de programación científica. Software libre y de código abierto, compatible con scripts de Matlab. |
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Un módulo Python eficiente para la manipulación y análisis estadístico de gráficos (también conocidos como redes). |
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Una versión de un solo archivo que solo contiene encabezados de la biblioteca de soporte de directrices ISO C++ para C++98, C++11 y versiones posteriores. |
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Una interfaz moderna compatible con C++11 que solo utiliza encabezados para libhdf5 |
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Biblioteca de inteligencia computacional bioinspirada. |
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Analizar el código fuente para comprobar la cobertura de las cadenas de documentación. |
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Un codificador/decodificador JSON/UBJSON/MessagePack para GNU Octave. |
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Una interfaz ligera de LLVM-Python para escribir compiladores JIT. |
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Triangulación de polígonos 2D muy rápida y bastante robusta.. |
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Rutinas para la creación de diagramas de Venn en Python/Matplotlib. |
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Falta un módulo de visualización de datos para Python. |
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Una biblioteca de Python y C++ para leer y escribir morfologías neuronales. |
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Conjunto de herramientas de Python para el análisis y procesamiento de morfologías neuronales. |
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Inferencia de cierre RDF basada en OWL-RL y RDFS para Python. |
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Gestor de entornos virtuales escrito íntegramente en Python. |
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Un amigo para recuperar tus archivos de datos. |
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Marco de trabajo para gestionar y mantener los hooks de pre‐commit multilingües. |
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Una biblioteca de barras de progreso para proporcionar información visual sobre el progreso de operaciones de larga duración.. |
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Una API de programación lineal en Python. |
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Biblioteca de Python para leer/escribir archivos EDF+/BDF+, basada en EDFlib. |
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Caja de herramientas para la exploración de parámetros. |
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Análisis del plano de fase de sistemas no lineales |
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Módulo de Python que proporciona limitación de velocidad. |
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Extensión rdflib para Python que añade analizador y serializador JSON-LD. |
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Algoritmos inspirados en la naturaleza para el ajuste de hiperparámetros de los modelos de Scikit-Learn. |
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Sistema de gestión de flujo de trabajo para crear análisis de datos reproducibles y escalables. |
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Un potente entorno científico escrito en Python, para Python, y diseñado por y para científicos, ingenieros y analistas de datos. |
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Decorador de control de tiempo de espera y administradores de contexto. |
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Implementa un algoritmo de ordenación topológica. |
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Visualización de datos categóricos. |
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wxnatpy es un widget de wxPython que permite a los usuarios explorar el contenido de un repositorio XNAT. |
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Un nuevo cliente XNAT que expone objetos/funciones XNAT como objetos/funciones de Python. |
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Una caja de herramientas portátil de compresión/descompresión de datos para GNU Octave. |
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Una biblioteca portátil con interfaces de compresión/descompresión de datos fáciles de usar. |
Pila de Ciencia Python
El grupo de paquete python-science incluye bibliotecas Python científicas utilizadas comúnmente. Esto puede ser instalado utilizando dnf:
sudo dnf install @python-scienceLos paquetes individuales además pueden ser instalados independientemente:
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Paquete de gráficos de Python. |
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Jupyter Notebook. |
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Paquete fundamental para el cálculo de matrices con Python. |
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Biblioteca de análisis de datos de Python. |
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La biblioteca de procesamiento de imágenes de Python. |
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Lee archivos ROI .zip o .roi generados con ImageJ. |
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Colección de algoritmos para el procesamiento de imágenes. |
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Aprendizaje automático en Python. |
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Biblioteca de Python para computación científica. |
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Estadística en Python. |
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Biblioteca para matemáticas simbólicas. |
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Una multiherramienta interactiva para datos tabulares. |
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