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6. Modifications dans Fedora pour les publics spécifiques

6.1. Scientifique et technique

6.1.1. ATpy

ATpy est une bibliothèque Python permettant de manipuler des tables astronomiques . Plus d'informations sont disponibles sur http://atpy.github.com/.

6.1.2. bowtie

bowtie est un aligneur de séquences courtes ultra rapide avec une gestion efficace de la mémoire. Il aligne des séquences courtes (35bp) du génome humain à une vitesse de plus de 25 millions de séquences courtes par heure. Bowtie indexe le génome avec la transformée de Burrows-Wheeler afin de garder une faible empreinte mémoire : environs 2,2 Gio pour le génome humain (2,9 Gio pour une lecture pairée). http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml.

6.1.3. DSDP

Le logiciel DSDP est une implémentation Open Source de la méthode de point intérieur pour la programmation semi-définie. Il propose les solutions primales et duales, exploite les structures de rang faible et une certaine disparité de données. De plus, il requiert une faible empreinte mémoire pour la méthode de point intérieur. Le point de départ peut être réaliste ou non et fournit un certificat d'infaisabilité lorsqu'aucune solution n'existe. L'algorithme de double codage (dual scaling) implémenté dans ce paquet est convergent et sous de faibles hypothèses sur les données, , une complexité polynomiale pour le pire des cas. La documentation complète est disponible sur http://www.mcs.anl.gov/hs/software/DSDP/.

6.1.4. fastx_toolkit

fastx_toolkit est un ensemble d'outils en ligne de commande permettant de traiter des fichiers de séquences courtes FASTA/FASTQ. http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/index.html.

6.1.5. IBSimu

Ion Beam Simulator ou IBSimu est un paquet de simulation d'ordinateur optique à ion pour l'optique, l'extraction de plasma et le transport spatial d'ions chargés en utilisant l'itération de Vlasov. Plus d'informations sont disponibles sur http://ibsimu.sourceforge.net/.

6.1.6. gappa

gappa est un outil destiné à aider à vérifier et prouver formellement des propriétés sur les programmes numériques traitant de l'arithmétique à virgule flottante ou fixe. Fedora 16 inclut une mise à jour à la version 0.15.0. Le site internet du projet est disponible à l'adresse http://gappa.gforge.inria.fr/.

6.2. Radio amateur

6.2.1. ax25-tools-x

ax25-tools-x propose une interface graphique à la configuration de soundmodem et au diagnostique d'applications.

6.2.2. cutecw

cutecw a été mis à jour vers la version 1.0. Les nouveautés comprennent de meilleures séquences d'entraînement, un mode de lecture amélioré et un grand nombre d'améliorations graphiques. Visitez http://www.hamtools.org/cutecw/.

6.2.3. hamlib

hamlib à été mis à jour vers la version 1.2.13.1. Voici les principales nouveautés :
  • la prise en charge des VX-1700, FUNcube, FiFi-SDR, KTH-SDR Si570, FT-5000 et TS-590S ;
  • un nouveau moteur d'arrière-plan possédant de nouvelles fonctionnalités ;
  • plusieurs corrections et ajout de fonctionnalités pour les TS-440S, K2, K3, SR-2200, THF6A, THF7E, TM-D700 et NewCAT rigs pour le port série par défaut ;
  • il autorise les VID et PID (vendeur et produit) de périphériques USB à être explicitement spécifiés.
Le rapport de version complet est disponible sur le site du projet à l'adresse http://hamlib.sourceforge.net/NEWS. Des informations plus générales sont accessibles sur le wiki du projet sur http://www.hamlib.org.

6.2.4. xnec2c

xnec2c version 1.5 incorpore de nombreuses améliorations par rapport à la version 1.2 :
  • la suppression des restrictions en excitation permettant de tracer le chemin de re-émission à partir d'une structure excitée par un champ incident ou une source de courant élémentaire ;
  • la correction d'arrêt brutaux de xnec2c 1.3 provoqués par la saisie d'un nom trop long (plus de 80 caractères) ;
  • la modification de la gestion des arguments de la ligne de commande de manière à ce que l'option -i ne soit plus nécessaire lors de la précision du nom de fichier ;
  • permettre le calcul du ratio avant/arrière lorsque l'antenne est modélisée par rapport à la terre.
Plus d'informations sont disponibles sur http://www.qsl.net/5b4az/pkg/nec2/xnec2c/doc/xnec2c.html.